各ユニットは，選択した系統のカスタムパーツを装着可能で，DQ10 RMTのゲーム通貨を現金で販売,買取するRMTサービスをおこなっています。充実したDQ10 RMTゲームライフを楽しんで頂くため。DQ10 RMTの通貨を効率よく稼げない方にも。DQ10 RMTのギルを出来る限り最安値で「安全」「安心」のサービスを提供いたしております。DQ10 RMTのギルを稼ぐ時間の少ない方にも。パーツによって特定のステータスが上昇したり，特殊な効果を得られたりする。したがって，もとが同じユニットであっても，パーツのチョイス次第で，まったく異なる性能と特性を持たせるようなカスタマイズも可能だ。なお，装着可能なカスタムパーツについては，ユニットレベルを上げるごとにアンロックされていく。
ちなみにカスタムパーツの装着スロットは1ユニットに付き最大四つで，カスタム2のユニットなら2スロット，カスタム3なら3スロットとあらかじめ決まっている。
「7系統合わせて261種類のカスタムパーツを用意しました。例えば格闘系統には45種類のパーツがあり，その組み合わせで，さまざまな特徴を持たせたユニットにカスタマイズできます。
またカスタムパーツは，特定の効果を得る代わりに，ほかの性能が下がるといった形で，メリットとデメリットのバランスを図っています。単純に，多くのカスタムパーツを装着できるユニットが強いということにはなっていませんので，ご安心ください」
「カスタムパーツの導入により，バズーカの着弾範囲を広げたり，射撃の連射速度を上げたり，あるいは格闘タイプであれば格闘攻撃範囲を広げたり，ブースターで移動速度を上げたりといった，これまでにない柔軟かつ多彩なカスタマイズが可能になります」
「カスタムパーツの導入によって，ご自身に合ったプレイスタイルを確立できます。また，なによりも特徴的なのは，プラモデルのカスタム化に代表されるような，SDガンダムというIPのイメージに沿った楽しみ方ができるようになることでしょう」（伴氏）
SDガンダム カプセルファイター オンライン
ただし，自由にカスタマイズできるとは言っても，ユニットによっては特定系統の武装が用意されていないケースもあるため，ある程度の制約は存在する。
なお，ゲーム内で獲得できるポイントを消費して，ユニットの系統をリセットすることも可能だ。リセットしてもユニットレベルはそのまま維持されるため，新たな系統のカスタムパーツも，そのレベルのものまでアンロックされた状態でスタートできるという。
「今回のアップデートでは，皆さんにユニットのカスタマイズをとことん楽しんでいただくことを重視しました。そのため，ゲームを継続してプレイし，ポイントを溜めていけば，自由に系統をリセットし，カスタマイズをやり直せるようにしています」
「ここは開発チームとも相当に議論を重ねた部分です。カスタマイズを楽しんでいただこうと考えたとき，お金を払わないとリセットできないようだと，どうしてもストレスになってしまいかねませんから。どんどんカスタムパーツを付け変えて，アレがいい，コレがいいと楽しんでほしいです」